تقوم إدارة الشؤون المالية بتوفير الخدمات المالية والمحاسبية لمنسوبي المعهد وتنظيم وتنفيذ العمليات وإعداد القيود المحاسبية والتقارير المالية وفقاً للوائح المالية والمحاسبية المعتمده كما تقوم بالمهام ولاختصاصات التالية :ـ
1ـ إعداد الخطه السنوية للقسم ومتابعة تنفيذها بعد اعتمادها.
2ـ إعداد الميزانية التقديرية بالتنسيق مع كافه الواحدات الإدارية في المعهد ومتابعة تنفيذها .
3ـ إعداد السجلات والقوائم والقيود المحاسبية ومتابعة الصرف على بنود الميزانية والتأكيد من الإلتزام بالبنود وإعداد المناقلات بين بنود وأبواب ميزانية المعهد .
4ـ إستكمال إجراءات مسيرات الرواتب وصرفها بالتنسيق مع قسم شؤون الموظفين وتنفيذ أوامر الصرف وإعداد الشيكات وأمر الدفع والتعاون مع المراقب الداخلي والممثل المالي وتزويدهما بالمعلومات اللازمه .
5ـ إعداد الحساب الختامي للمعهد .